Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
ZNF479Q96JC4 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms