Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NRF1Q16656 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms