Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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NBR1Q14596 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms