Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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PTCH1Q13635 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTCH1Q13635 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTCH1Q13635 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTCH1Q13635 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTCH1Q13635 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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PTCH1Q13635 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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