Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPL23P62829 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPL23P62829 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPL23P62829 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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