Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms