Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANGAP1P46060 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANGAP1P46060 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms