Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP1P29466 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP1P29466 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms