Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJB2P29033 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJB2P29033 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GJB2P29033 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GJB2P29033 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms