Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XBP1P17861 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XBP1P17861 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XBP1P17861 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
XBP1P17861 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XBP1P17861 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XBP1P17861 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XBP1P17861 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XBP1P17861 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
XBP1P17861 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms