Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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SCN2BO60939 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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SCN2BO60939 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SCN2BO60939 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SCN2BO60939 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SCN2BO60939 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SCN2BO60939 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SCN2BO60939 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCN2BO60939 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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