Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XIRP2A4UGR9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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