Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms