Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP35Q9P2H5 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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