Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CRACR2AQ9BSW2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms