Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLF1Q9BQI6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms