Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMYD4Q8IYR2 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMYD4Q8IYR2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms