Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLD3Q8IV08 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms