Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms