Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SYT16Q17RD7 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms