Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NBR1Q14596 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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