Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LRTOMT-207ENST00000435085 3194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ZNF839-206ENST00000558850 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TNFSF13B-202ENST00000430559 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 SUSD4-207ENST00000484758 2736 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RTEL1P1-201ENST00000504490 3685 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD300CQ08708 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms