Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2FP61218 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2FP61218 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms