Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms