Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCAMP43121 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCAMP43121 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms