Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TNFSF9P41273 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TNFSF9P41273 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TNFSF9P41273 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TNFSF9P41273 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TNFSF9P41273 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TNFSF9P41273 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TNFSF9P41273 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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