Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms