Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP4AP20648 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms