Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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