Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFIP11Q9UBB9 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFIP11Q9UBB9 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms