Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ERVK-18Q9QC07 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms