Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARHGAP28Q9P2N2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms