Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF397Q8NF99 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms