Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HERC6Q8IVU3 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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