Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APTXQ7Z2E3 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms