Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01545Q5VT33 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms