Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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