Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NBR1Q14596 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms