Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1SQ13698 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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