Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN2Q02246 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms