Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLCP48506 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GCLCP48506 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCLCP48506 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms