Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCAMP43121 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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