Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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CXCR5P32302 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CXCR5P32302 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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