Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
IL3RAP26951 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms