Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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CCNA2P20248 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CCNA2P20248 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CCNA2P20248 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CCNA2P20248 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CCNA2P20248 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CCNA2P20248 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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