Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP8A2Q9NTI2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP8A2Q9NTI2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms