Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms