Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms