Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TLR1Q15399 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms