Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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